Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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