Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms