Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms