Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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