Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prr16A3KMN5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms