Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms