Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4985A2ALC6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms