Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms