Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms