Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms