Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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