Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms