Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms