Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfkbiaQ9Z1E3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms