Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms