Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms