Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms