Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col4a3Q9QZS0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col4a3Q9QZS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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