Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms