Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms