Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Tnnt3Q9QZ47 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Tnnt3Q9QZ47 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Tnnt3Q9QZ47 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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