Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mid2Q9QUS6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms