Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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