Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms