Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dclk1Q9JLM8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms