Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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