Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms