Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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