Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1cc1Q9ESK9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms