Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Aff4Q9ESC8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Aff4Q9ESC8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Aff4Q9ESC8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Aff4Q9ESC8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aff4Q9ESC8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Aff4Q9ESC8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Aff4Q9ESC8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Aff4Q9ESC8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Aff4Q9ESC8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aff4Q9ESC8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms