Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trappc4Q9ES56 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc4Q9ES56 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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