Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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