Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn12Q9ER56 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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