Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms