Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms