Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tmem43Q9DBS1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tmem43Q9DBS1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem43Q9DBS1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem43Q9DBS1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem43Q9DBS1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms