Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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