Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp12Q9D9M2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp12Q9D9M2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp12Q9D9M2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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