Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms