Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srp19Q9D7A6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp19Q9D7A6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms