Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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