Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms