Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al3Q9D4U4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms