Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms