Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms