Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms