Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms