Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms