Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Urm1Q9D2P4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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