Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms